記者3月28日從業(yè)內(nèi)獲悉,被業(yè)內(nèi)稱(chēng)為“破解生命密碼”的國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目——“前沿生物技術(shù)”重點(diǎn)專(zhuān)項(xiàng)“全基因組-環(huán)境/生活方式暴露與跨尺度表型組大數(shù)據(jù)整合分析”日前正式啟動(dòng)。
項(xiàng)目由福建醫(yī)科大學(xué)副校長(zhǎng)、公共衛(wèi)生學(xué)院院長(zhǎng)葉為民教授主持,醫(yī)渡科技與復(fù)旦大學(xué)、西湖大學(xué)、武漢大學(xué)、山東大學(xué)、中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)院等10家優(yōu)勢(shì)單位協(xié)同攻關(guān),為心腦血管疾病、糖尿病、惡性腫瘤及慢性呼吸系統(tǒng)疾病四大慢病防治策略及措施開(kāi)發(fā)提供新思路。
作為核心參與單位,醫(yī)渡科技主要承擔(dān)疾病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)模型構(gòu)建、多維表型組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析系統(tǒng)建設(shè)等關(guān)鍵任務(wù)。項(xiàng)目的啟動(dòng)是我國(guó)在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域又一關(guān)鍵落子。
如果說(shuō)人類(lèi)基因組計(jì)劃讓科學(xué)家手里有了探索生命奧秘的“指南針”,那么人類(lèi)表型組計(jì)劃就將打造未來(lái)遨游生命科學(xué)世界的“全球衛(wèi)星定位系統(tǒng)”。表型組數(shù)據(jù)具有量大、跨尺度和多維度等特點(diǎn),在與遺傳易感性、環(huán)境暴露及生活方式等傳統(tǒng)疾病風(fēng)險(xiǎn)因素整合分析時(shí),面臨數(shù)據(jù)質(zhì)量不一、缺乏共享云平臺(tái)及多維數(shù)據(jù)分析方法有限的問(wèn)題。因此需要建立數(shù)據(jù)歸檔標(biāo)準(zhǔn),構(gòu)建高性能云平臺(tái),并開(kāi)發(fā)多維組學(xué)數(shù)據(jù)計(jì)算方法,為表型組在疾病防治研究中的應(yīng)用提供必要的數(shù)據(jù)、平臺(tái)和方法支持。
表型組已經(jīng)成為繼基因研究之后,事關(guān)生物醫(yī)學(xué)技術(shù)長(zhǎng)遠(yuǎn)和全局發(fā)展的戰(zhàn)略高地。項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)將著眼國(guó)際科技競(jìng)爭(zhēng)前沿,建立覆蓋“表型組數(shù)據(jù)采集-存儲(chǔ)-分析-應(yīng)用”的全鏈條方法體系,將利用我國(guó)人群隊(duì)列,聚焦心腦血管疾病、糖尿病、惡性腫瘤及慢性呼吸系統(tǒng)疾病四大慢病。
例如,繪制疾病發(fā)生發(fā)展過(guò)程中宏觀(guān)至微觀(guān)表型的跨尺度關(guān)聯(lián)圖譜,全面解析遺傳和環(huán)境/生活方式暴露下、機(jī)體宏觀(guān)疾病、功能、器官表型至微觀(guān)分子、細(xì)胞表型特征變化;繪制疾病發(fā)生發(fā)展過(guò)程中跨尺度關(guān)聯(lián)圖譜,發(fā)現(xiàn)疾病防治關(guān)鍵靶點(diǎn);利用機(jī)器學(xué)習(xí)、深度學(xué)習(xí)等方法構(gòu)建人工智能疾病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)模型。
如果把人體比作一本復(fù)雜的“生命密碼本”,那么這項(xiàng)研究就是要破解其中的關(guān)鍵章節(jié)。醫(yī)渡科技重點(diǎn)參與“常見(jiàn)疾病關(guān)鍵靶點(diǎn)及預(yù)測(cè)模型研究”任務(wù),負(fù)責(zé)預(yù)測(cè)模型構(gòu)建與多維表型組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析系統(tǒng)建設(shè)。研究團(tuán)隊(duì)將依托福清隊(duì)列數(shù)據(jù),整合傳統(tǒng)危險(xiǎn)因素與圖譜篩選的候選特征,運(yùn)用機(jī)器學(xué)習(xí)、深度學(xué)習(xí)等技術(shù)開(kāi)發(fā)獨(dú)立與綜合風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)模型,并實(shí)現(xiàn)算法軟件化,助力算法、模型或分析流程在疾病防治研究中的推廣應(yīng)用。
醫(yī)渡科技的“AI醫(yī)療大腦”YiduCore,經(jīng)授權(quán)處理分析了超55億份醫(yī)療記錄,覆蓋超2800家醫(yī)院網(wǎng)絡(luò),疾病知識(shí)圖譜基本涵蓋所有已知疾病。